Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms