Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprnQ60673 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms