Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd5Q5VCS6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tdrd5Q5VCS6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd5Q5VCS6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd5Q5VCS6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms