Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpa6Q5U901 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms