Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms