Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms