Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Med13Q5SWW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Med13Q5SWW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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