Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf12Q5SPL2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf12Q5SPL2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms