Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms