Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trim41Q5NCC3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim41Q5NCC3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms