Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm3558Q5FWC9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3558Q5FWC9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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