Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prkaa1Q5EG47 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms