Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5EBG8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5EBG8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5EBG8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms