Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms