Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms