Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd28Q505D1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms