Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms