Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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