Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prr7Q3V0I2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr7Q3V0I2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms