Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp48Q3V0C5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp48Q3V0C5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp48Q3V0C5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp48Q3V0C5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms