Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed1Q3V009 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms