Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms