Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm27235Q3UW50 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm27235Q3UW50 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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