Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms