Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Znf48Q3US17 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Znf48Q3US17 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Znf48Q3US17 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Znf48Q3US17 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Znf48Q3US17 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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