Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp30Q3UN04 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp30Q3UN04 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp30Q3UN04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp30Q3UN04 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp30Q3UN04 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms