Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cog7Q3UM29 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms