Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pin1rt1Q3ULQ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms