Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms