Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx27Q3UHD6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx27Q3UHD6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms