Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms