Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Parp8Q3UD82 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp8Q3UD82 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms