Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gse1Q3U3C9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms