Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms