Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pbxip1Q3TVI8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pbxip1Q3TVI8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms