Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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