Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uri1Q3TLD5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uri1Q3TLD5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms