Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cwc27Q3TKY6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cwc27Q3TKY6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms