Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms