Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3KNL4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3KNL4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms