Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Specc1lQ2KN98 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms