Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shroom4Q1W617 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Shroom4Q1W617 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Shroom4Q1W617 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Shroom4Q1W617 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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