Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samd11Q1RNF8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms