Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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