Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300lgQ1ERP8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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