Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptcd3Q14C51 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms