Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms