Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms