Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli2Q0VGT2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms