Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ttc39dQ0VF76 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc39dQ0VF76 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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